ارتباط بین گروه های فیلوژنتیکی با ژن های کد کننده فاکتور های حدت در ایزوله های اشریشیاکلای خارج روده ای به روش Multiplex-PCR

خلاصه سابقه و هدف: باکتری اشریشیاکلای خارج روده ای مهمترین عامل عفونت های ادراری-تناسلی در انسان است. چندین فاکتور حدت مثل ژن های کد کننده پروتئین های سیتوتوکسین، ادهسین، رسپتورهای سیدروفور و پروتئاز خارج غشائی در اشریشیاکلای های خارج روده ای انسان شناسایی شده است. این مطالعه به منظور بررسی میزان توزیع ژن های کد کننده فاکتور های حدت و ارتباط آن با گروه های فیلوژنتیکی در ایزوله های اشریشیاکلای جدا شده از بیماران مراجعه کننده به کلینیک های زنان شهرستان زابل انجام شد. مواد و روشها: در این مطالعه مقطعی تعداد 132 باکتری اشریشیاکلای با استفاده از روش های بیوشیمیایی استاندارد جداسازی شد.  DNAژنومی تمام ایزوله ها به روش جوشاندن استخراج گردید. حضور ژن های کد کننده فاکتور های حدت سیتوتوکسین (cnf1)، ادهسین غیرهموآگلوتنین (iah)، همولوگ سیدروفور (irp2) و پروتئاز خارج سلولی (ompT) به روش Multiplex-PCR مورد بررسی قرار گرفت. گروه بندی فیلوژنتیکی تمام ایزوله ها با استفاده از حضور یا عدم حضور ژن های chuA، yjaA و قطعهTspE4.C2 به روش Triple-PCR انجام شد. یافته‌ها: میزان شیوع ژن های های cnf1، iha، irp2 وompT در بین 132 ایزوله به ترتیب 10%، 8%، 45% و 63% تعیین گردید. از مجموع 132 ایزوله اشریشیاکلای 14، 7، 60 و 19 درصد به ترتیب در گروه های فیلوژنتیکی A، B1، B2 و D قرار گرفتند. بیشترین میزان توزیع ژن های کد کننده فاکتور های حدت در گروه B2 با فراوانی cnf1(100%)، iha(5/62%)، irp2(01/73%) وompT(44/84%) نسبت به سایر گروه ها تعیین گردید. نتیجه گیری: نتایج این مطالعه نشان داد که ompT وirp2  شایعترین ژن های کد کننده فاکتور های حدت درایزوله های اشریشیاکلای خارج روده ای جدا شده از عفونت دستگاه تناسلی می باشد. این مسئله می تواند اطلاعاتی در رابطه با اهمیت آنها در آسیب شناسی عفونت دستگاه تناسلی که منجر به دست یابی به درمان های موثرتر می شود در اختیار محققین قرار دهد.